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干貨 | qPCR 實驗中關于 CT 值問題的詳細攻略(上)

發布時間:2019-11-05 09:45 信息來源(yuan): 閱讀次數: 次

qPCR 實驗在分析 C時常常遇到這幾類問題,比如:


  • 復孔間(jian)重(zhong)復性(xing)差,是否都和操(cao)作(zuo)有(you)關(guan)?

  • 無模板陰性對照出現 C值時,目的基因的 C值是否還能用?

  • C值很大該怎么辦?


今天就給大家分享下,在 qPCR 實驗中遇到關于 C值的常見問題時該如何解決。


復孔間重復性差怎么辦?


復孔間重復性(xing)差一般(ban)會(hui)有(you)以(yi)下(xia)兩種情況:


(1)C值很大,如 C≥ 30,重復性差屬于正常現象。該現象符合泊松分布,即在有效模板量很少的情況下,模板與引物的碰撞存在隨機性,直接導致復孔間的 C值差異較大。


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解決方法:如果融解曲線沒有雜峰,無模板陰性對照同目的基因的 △C值為 3 or 5 以上,那 C值為準確的,可多設置幾個復孔,選擇重復性好的 C值參與計算。


(2)C<30,重復性較差。這種情況一般(ban)同操作有(you)關(guan)。


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解決辦法:從以下幾個方面進行問題的排查:① 加樣準(zhun)確度;② 移液器吸取液體的準(zhun)確度;③ 定期校準(zhun) qPCR 儀。


① 加樣準確度


  • 避免小體積加樣,減少加樣誤差。可以將引物、SYBR Green Mix、ddH2O 配置成混合體系,并且增加模板的稀釋梯度,大體積加樣。如:原液 cDNA 添加 1 μL,可以更改為原液 cDNA 稀釋 5 倍,添加 5 μL,使用 ddH2O 補齊體系至 20 μL 即可。

  • SYBR Green Mix、配(pei)置的混合體系需(xu)要混合均勻(yun)(yun)。從 -20 ℃ 冰箱拿出的試劑需(xu)要完全融化(hua)并上下顛倒(dao)徹底混勻(yun)(yun);配(pei)置體系時(shi),將(jiang)混在一起的 Mix 用移液器(qi)吹打混勻(yun)(yun)。


② 移液(ye)器吸取液(ye)體的(de)準確度(du)


  • 移液(ye)器(qi)量程(cheng)定期校(xiao)準(zhun),校(xiao)準(zhun)周期為 1 年。

  • 購買與移液器配(pei)套的(de)槍(qiang)頭(tou),若槍(qiang)頭(tou)與移液器不匹配(pei),在吸(xi)取(qu)(qu)液體時易出現漏氣的(de)現象,導致(zhi)吸(xi)取(qu)(qu)量程(cheng)不準確。

  • 在(zai)(zai)吸(xi)取(qu)相(xiang)同量(liang)程的液(ye)體體積(ji)時(shi),注意(yi)觀察每次吸(xi)取(qu)液(ye)體在(zai)(zai)槍(qiang)頭內(nei)的液(ye)面高度是否一致。


③ 定(ding)期校準 qPCR 儀(yi)


  • 一般 qPCR 儀校準周期為一年。



未(wei)完待續...

轉自:諾唯贊(zan)