Jiachang Biological - biotechnology services and research and development as one of the high-tech enterprises
High qualityefficienttransparent
High quality, efficient and transparent
發布時間:2019-11-05 09:45 信息來源(yuan): 閱讀次數: 次
qPCR 實驗在分析 CT 時常常遇到這幾類問題,比如:
復孔間(jian)重(zhong)復性(xing)差,是否都和操(cao)作(zuo)有(you)關(guan)?
無模板陰性對照出現 CT 值時,目的基因的 CT 值是否還能用?
CT 值很大該怎么辦?
今天就給大家分享下,在 qPCR 實驗中遇到關于 CT 值的常見問題時該如何解決。
復孔間重復性差怎么辦?
復孔間重復性(xing)差一般(ban)會(hui)有(you)以(yi)下(xia)兩種情況:
(1)CT 值很大,如 CT ≥ 30,重復性差屬于正常現象。該現象符合泊松分布,即在有效模板量很少的情況下,模板與引物的碰撞存在隨機性,直接導致復孔間的 CT 值差異較大。
解決方法:如果融解曲線沒有雜峰,無模板陰性對照同目的基因的 △CT 值為 3 or 5 以上,那 CT 值為準確的,可多設置幾個復孔,選擇重復性好的 CT 值參與計算。
(2)CT <30,重復性較差。這種情況一般(ban)同操作有(you)關(guan)。
解決辦法:從以下幾個方面進行問題的排查:① 加樣準(zhun)確度;② 移液器吸取液體的準(zhun)確度;③ 定期校準(zhun) qPCR 儀。
① 加樣準確度
避免小體積加樣,減少加樣誤差。可以將引物、SYBR Green Mix、ddH2O 配置成混合體系,并且增加模板的稀釋梯度,大體積加樣。如:原液 cDNA 添加 1 μL,可以更改為原液 cDNA 稀釋 5 倍,添加 5 μL,使用 ddH2O 補齊體系至 20 μL 即可。
SYBR Green Mix、配(pei)置的混合體系需(xu)要混合均勻(yun)(yun)。從 -20 ℃ 冰箱拿出的試劑需(xu)要完全融化(hua)并上下顛倒(dao)徹底混勻(yun)(yun);配(pei)置體系時(shi),將(jiang)混在一起的 Mix 用移液器(qi)吹打混勻(yun)(yun)。
② 移液(ye)器吸取液(ye)體的(de)準確度(du)
移液(ye)器(qi)量程(cheng)定期校(xiao)準(zhun),校(xiao)準(zhun)周期為 1 年。
購買與移液器配(pei)套的(de)槍(qiang)頭(tou),若槍(qiang)頭(tou)與移液器不匹配(pei),在吸(xi)取(qu)(qu)液體時易出現漏氣的(de)現象,導致(zhi)吸(xi)取(qu)(qu)量程(cheng)不準確。
在(zai)(zai)吸(xi)取(qu)相(xiang)同量(liang)程的液(ye)體體積(ji)時(shi),注意(yi)觀察每次吸(xi)取(qu)液(ye)體在(zai)(zai)槍(qiang)頭內(nei)的液(ye)面高度是否一致。
③ 定(ding)期校準 qPCR 儀(yi)
一般 qPCR 儀校準周期為一年。
未(wei)完待續...
轉自:諾唯贊(zan)